Sequence Manipulation Suite:
Pairwise Align Codons
Pairwise Align Codons acepta dos secuencias codificantes y determina su alineamiento global óptimo. Puede encontrar la descripción de la matriz de puntuación que se utiliza para calcular el alineamiento en Schneider et al. (2005). Utilice Pairwise Align Codons para buscar las regiones que se conserven de secuencias codificantes. Sólo se utilizan en este alineamiento las bases A,C,G,T,U.

Pegue la primera secuencia (en formato RAW o FASTA) en el siguiente cuadro de texto. 6000 caracteres máximo.

Pegue la segunda secuencia (en formato RAW o FASTA) en el siguiente cuadro de texto. 6000 caracteres máximo.

Por favor revise la lista de navegadores compatibles antes de utilizar este programa.

Utilice los siguientes parámetros para especificar cómo puntuar los alineamientos:
  • Valor de los GAP precedentes a una secuencia
  • Valor de los GAP internos
  • Valor de los GAP posteriores a una secuencia
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Tue Jun 15 14:20:12 2010
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