Sequence Manipulation Suite:
CpG Islands
CpG Islands informa de posibles regiones de islas CpG por medio del método descrito por Gardiner-Garden y Frommer (1987). El cálculo se realiza con una ventana de 200 pb que se mueve a lo largo de la secuencia en intervalos de 1 pb. Las islas CpG se definen como rangos de secuencia donde el valor Obs/Exp es mayor que 0.6 y el contenido de GC es mayor que el 50%. El número esperado de dímeros CpG en una ventana se calcula como el número de 'C' multiplicado por el número de 'G'que haya en la ventana, dividido entre el largo de la ventana. Las islas CpG a menudo se encuentran en las regiones 5' de los genes de los vertebrados, así pues, este programa puede utilizarse para resaltar los posibles genes en secuencias genómicas.

Pegue su secuencia en formato RAW o una o más en formato FASTA en el siguiente cuadro de texto. 100000 caracteres máximo.

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Tue Jun 15 14:20:12 2010
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